In Silico

Funkcionális elemzés

A nagyáteresztőképességű mérések fejlődésével az orvosbiológiai változók száma korábban elképzelhetetlen ütemben nőtt meg. Az adatokhoz szükséges mérések és az elemzéshez szükséges számítás relatív egyre olcsóbbá válásával, illetve a mérések és az elemzések hipotézismentes voltával azonban az értelmezési fázis vált egyre hangsúlyosabbá, sőt a gyakorlatban az értelmezés vált a modern orvosbiológiai kutatások szűk keresztmetszetévé. A változók nagy számára válaszul megjelentek az eredményeket több változó együttesén vizsgáló módszerek, ahol a változók együtteseit a tárgyterület szemantikája, a meglévő háttértudás definiálja. Ez a meglévő háttértudás a priori annotációkat (halmazba sorolást), taxonómiákat, biológiai szintek közötti megfeleltetést, vagy akár úrvonalhálózatokat is jelenthet.

Megoldásaink a következő aspektusokban nyújtanak többet:

• Az annotációk hozzárendelése és kapcsolódása is lehet bizonytalan, amely akár egy teljes rendszert, egy valószínűségi tudásbázist is jelenthet. A valószínűségi tudásbázis egy része az a priori háttértudást tartalmazza a következő egymással összekapcsolt szinteken:
  • szabadszöveges kapcsolatokat tartalmazó összefoglaló,
  • szövegbányászati eszközökkel kivonatolt tudásbázis,
  • kötött szótár és nyelvtan felhasználásával létrehozott összefoglaló,
  • logikai tudásbázis,
  • függési- és oksági modell.
• Az annotációkhoz kvantitatív jellemző, egy hasznosságfüggvény is kapcsolható, amelyekkel a statisztikai érintettség mellett plusz információkat lehet kifejezni.